基因工程是利用植物隱藏的力量制造藥物的有效方法。但是，從生物多樣性保護的角度來看，在開闊地種植轉基因植物已經受到法律的規范。在AIST，在北海道中心建造了一個完全封閉式植物工廠的試驗工廠，正在開發利用轉基因植物制造藥物的技術，不受任何外部影響。
一般而言，“植物工廠”是指在不受自然氣候變化影響的完全調節的環境條件下培養植物的系統。在 AIST 的植物工廠，正在研究和開發使用基因重組技術使植物生產高附加值材料，如藥物，培養室內的溫度、濕度、二氧化碳濃度、風速和氣流。自由而***地控制（例如，可以再現仲夏節的天氣條件），正在種植轉基因植物，并且正在生產藥物成分。
當然，由于以種植轉基因植物為前提，該設施配備了符合《生物多樣性保護和可持續利用法》中《改性活生物體利用條例》的遏制設備。由于有一個與種植區相結合的制藥區，因此可以在封閉式植物工廠內實施從種植到藥物制造的一致過程。
AIST的植物工廠生產的***個產品是狗用牙齦炎癥抑制藥，它是由轉基因草莓生產的，現在已經開始銷售。